Protein–RNA interactions for Protein: B1AY13

Usp24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp24B1AY13 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp24B1AY13 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp24B1AY13 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp24B1AY13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms