Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm436B1AVU6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm436B1AVU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 516.4 ms