Protein–RNA interactions for Protein: B1AUC4

Ube2u, Ubiquitin-conjugating enzyme E2U (putative), mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2uB1AUC4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ube2uB1AUC4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ube2uB1AUC4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms