Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spocd1B1ASB6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms