Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grik3B1AS29 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms