Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn8B1ARD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms