Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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