Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms