Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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