Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms