Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms