Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2al1jA2BFR3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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