Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scn3aA2ASI5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scn3aA2ASI5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms