Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rtf1A2AQ19 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rtf1A2AQ19 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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