Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scn1aA2APX8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1aA2APX8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms