Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtcflA2APF3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms