Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cavin4A2AMM0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cavin4A2AMM0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms