Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FocadA2AKG8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms