Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Frmpd1A2AKB4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Frmpd1A2AKB4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms