Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Prdm12A2AJ77 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms