Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ambra1A2AH22 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ambra1A2AH22 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms