Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Frmpd4A2AFR3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Frmpd4A2AFR3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms