Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem185aA2AF53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem185aA2AF53 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms