Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prdm2A2A7B5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prdm2A2A7B5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prdm2A2A7B5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms