Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Calcoco2A2A6M5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calcoco2A2A6M5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms