Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nlrp1bA1Z198 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nlrp1bA1Z198 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms