Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trav12-2A0N8N6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trav12-2A0N8N6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms