Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms