Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms