Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Gm28360A0A087WR25 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm28360A0A087WR25 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Gm28360A0A087WR25 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28360A0A087WR25 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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