Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm44059-201ENSMUST00000204048 351 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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Limd1Q9QXD8 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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