Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg9Q9DB90 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg9Q9DB90 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms