Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm19232-201ENSMUST00000211621 652 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.3 ms