Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 1700095K22Rik-201ENSMUST00000206808 282 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NipblQ6KCD5 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms