Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38152-201ENSMUST00000195389 3566 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms