Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Hoxa13Q62424 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Hoxa13Q62424 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Hoxa13Q62424 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms