Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Odf1Q61999 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Odf1Q61999 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms