Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
PtprnQ60673 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm20144-201ENSMUST00000203031 165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PtprnQ60673 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms