Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26121-201ENSMUST00000083364 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Sft2d1Q5SSN7 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
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