Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Trappc1Q5NCF2 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Trappc1Q5NCF2 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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Trappc1Q5NCF2 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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Trappc1Q5NCF2 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm11982-201ENSMUST00000121480 314 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Trappc1Q5NCF2 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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