Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Fam208bQ5DTT3 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms