Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AC126275.2-201ENSMUST00000225224 253 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 2810428J06Rik-201ENSMUST00000198336 2696 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr804-201ENSMUST00000077312 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Cpne9Q1RLL3 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms