Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC166056.1-201ENSMUST00000223139 441 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm24224-201ENSMUST00000158828 258 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Sh3bp1P55194 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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