Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
TspoP50637 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 1700007K09Rik-202ENSMUST00000188899 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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TspoP50637 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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TspoP50637 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Vmn1r71-207ENSMUST00000228248 5469 ntAPPRIS P2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
TspoP50637 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
TspoP50637 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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