Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
PtprmP28828 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm13439-201ENSMUST00000117541 409 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PtprmP28828 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms