Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Hoxd9P28357 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms