Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Ccl20O89093 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm25537-201ENSMUST00000103851 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccl20O89093 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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