Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Rtf1A2AQ19 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm14559-201ENSMUST00000121745 496 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm12002-203ENSMUST00000174550 923 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rtf1A2AQ19 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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