Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Snord47-201ENSMUST00000083034 77 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Limd1Q9QXD8 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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