Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
Col5a3Q9JLI2 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm43992-201ENSMUST00000204358 197 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Col5a3Q9JLI2 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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